Je jednou z hlavních stavebních části chrupavky. Má výjimečnou schopnost zadržovat vodu v chrupavce a tím zajišťovat její elasticitu a mechanické vlastnosti. Snižuje aktivitu enzymů, poškozujících kloubní chrupavky a má protizánětlivé účinky. Chondroitin sulfát zároveň ovlivňuje činnost cév krevních kapilárách v blízkosti kloubních struktur.
Má protitrombotický účinek, snižuje hladinu cholesterolu v krvi a tím přispívá razantně ke snížení srdečně cévních a mozkových příhod.
Síra obsažená v molekule Chondroitin sulfát zajišťuje chrupavkám hladkost povrchu, výborné mechanické vlastnosti, optimální vlhkost (snížení bolesti poškozené tkáně), pružnost a tvar (zvýšení kloubní pohyblivosti v postiženém místě), prostorové využití dutinových dorostů.